张志清

师资队伍

  • 张志清
    性别 : 所属部门 : 现代光学研究所
    职称 : 副教授 学历 : 博士
    行政职务 : 所学专业 : 生物物理、数学、计算机
    办公电话 :
    邮箱 : zhiqing.andy_zhang@nankai.edu.cn
    研究方向 : 非线性成像、单分子成像、人工智能、遥感、肿瘤、神经疾病

个人简历

福建省清流县人,19854月生。

2008年毕业于北京师范大学数学与应用数学专业,获学士学位;

2011年毕业于北京师范大学基础数学专业,获硕士学位;

2011-2013年先后供职于IVT科技有限公司和北京清华同衡规划设计研究院,任高级软件工程师;

2017年毕业于荷兰阿姆斯特丹自由大学(Vrije Universiteit Amsterdam)物理学院和阿姆斯特丹医学中心(Amsterdam UMC- VUmc),获博士学位;

2017-2020年在阿姆斯特丹自由大学物理学院,进行生物物理方向的博士后研究;

2020-2022年在比利时鲁汶大学(KU Leuven)医学院,进行神经科学方向的博士后研究;

20221月进入南开大学电子信息与光学工程学院现代光学研究所工作,担任副教授,入选南开大学百名青年学科带头人培养计划。

2023年起担任南开大学电子信息与光学工程学院博导。

2025年起担任南开国际先进研究院(深圳福田)副教授、博导。


主要从事生物医学相关的光学成像研究工作,研究方向包括非线性成像、单分子成像、肿瘤诊断、神经疾病、医学图像处理、遥感图像处理与人工智能等。以第一作者/通讯作者在Matter & LightPNASAdvanced ScienceIEEE JBHIBioinformatics等期刊发表系列论文,并多次在相关国内外会议上进行口头报告。


欢迎光学、物理、生物、医学、数学和计算机等背景的同学报考/申请博士、硕士生及博士后。


科研项目/成果/获奖/专利

(1) 深圳市医学研究专项,C012026-012029-12,主持,70万元。

(2) 南开大学百名青年学科带头人培养计划,2023-012027-12,主持,50万元。

(3) 其它横向与纵向项目,50万元。

(4) 申请专利2项。



论文/专著/教材

1. Q Bo, J Wu, C Li, L Yu, Z Deng, X Wang, S Chang, G Li, S Qiu*, Z Zhang*. Short-pulsed AI-augmented third harmonic generation imaging visualizes negative-contrast cell nuclei in fresh mouse liver tissue without optical-induced damage. Submitted (通讯作者), 2026. 预印版:https://doi.org/10.1364/opticaopen.32314290.

2. Y Wu, S Spies, Q Bo, Y Zhang, J Qi, P Wesseling, M L Groot*, Z Zhang*. Chromatin features as a label-free biomarker for intraoperative diagnosis of CNS tumors by AI-augmented third harmonic generation microscopy. Matter & Light (Cell Press,通讯作者), 2026.

3. Z Sun, J Ma, C Meng, L Zhao, L Huo, T Li*, Z Zhang*, S Chang*. Overlapping Pyramid Vision Enables Instance-Level Sar Ship Detection and Classification. IEEE JSTARS (共同通讯作者), vol. 19, pp. 18999-19016, 2026.

4. J Ma, L Zhao, L Huo, C Meng, Z Zhang*. BLCNet: A Blind-spot Guided Local-Nonlocal Collaborative Self-supervised Denoising Network for SAR Images. IEEE Geoscience and Remote Sensing Letters (通讯作者), vol. 23, pp. 1-5, 2026.

5. C. Meng, Z. Sun*, L. Huo, T. Li, S. Chang, Z. Zhang*. An Embedded Feature Pyramid Network Enables Bidirectional Information Flow for Object Detection and Instance Segmentation. Neurocomputing (通讯作者), 619, 129196, 2025.

6. 薄启宇,吴宇辰,邱斯奇,张志清*。三次谐波显微成像在肿瘤诊断中的应用进展研究。《中国激光》(通讯作者)51卷,03期,2024

7. Wu, S. Qiu, M. L. Groot, Z. Zhang*. Self-Supervised Image Denoising of Third Harmonic Generation Microscopic Images of Human Glioma Tissue by Transformer-based Blind Spot (TBS) Network. IEEE JBHI (通讯作者), 28 (8), 4688 – 4700, 2024.

8. Z. Sun, C. Meng, T. Huang, Z. Zhang*, S. Chang. Marine ship instance segmentation by deep neural networks using a global and local attention (GALA) mechanism. Plos one (通讯作者), 18(2), e0279248, 2023.

9. Z. Sun, C. Meng, J. Cheng, Z. Zhang*, S. Chang. A Multi-Scale Feature Pyramid Network for Detection and Instance Segmentation of Marine Ships in SAR Images. Remote Sensing (通讯作者), 14(24), 6312, 2022.

10. Z. Zhang; N. Danné; B. Meddens; I. Heller; E. J G Peterman ; Direct imaging of intraflagellar-transport turnarounds reveals that motors detach, diffuse, and reattach to opposite-direction trains, Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS, 第一作者), 118(45), 2021.

11. Z. Zhang; J. C.de Munck; N. Verburg; A. J. Rozemuller; W. Vreuls; P. Cakmak; L. M. G. van Huizen; S. Idema; E. Aronica; P. C.de Witt Hamer; P. Wesseling; M. L. Groot ; Quantitative Third Harmonic Generation Microscopy for Assessment of Glioma in Human Brain Tissue, Advanced Science (第一作者), 6(11), 2019.

12. Z. Zhang*, M. L. Groot, J. C.de Munck; Tensor regularized total variation for denoising of third harmonic generation images of brain tumors, Journal of Biophotonics (第一作者), 12(1), 2019.

13. Z Zhang*; N V. Kuzmin; M L Groot; J C.de Munck; Quantitative comparison of 3D third harmonic generation and fluorescence microscopy images, Journal of Biophotonics (第一作者), 11(1), 2018.

14. Z. Zhang*; N. V. Kuzmin; M. L. Groot; J. C.de Munck; Extracting morphologies from third harmonic generation images of structurally normal human brain tissue, Bioinformatics (第一作者), 33(11), 2017.


讲授课程

本科生大类必修课 《人工智能与创新(C++程序设计)》

本科生专业选修课 《生物医学光子学》

本科生通识选修课《光、细胞与AI的交汇》

研究生选修课 《面向光学的机器学习》


社会兼职

Advanced Science, Journal of Biophotonics, Biomedical Optics Express, Journal of Biomedical Optics, Advanced Intelligent Systems, Advanced Theory and Simulations等期刊审稿人。